En la actualidad la ecología se divide en varias ramas entre las que se cuentan
Autoecología
Estudio las relaciones entre un solo tipo organismo (especie) y el medio en que vive.(población)
Sinecología
Estudia las relaciones entre diversas especies pertenecientes a un mismo grupo y el medio en que viven (comunidad)
Dinámica de poblaciones
Estudia las causas y modificaciones de la abundancia de especies en un medio dado, es decir los cambios que se presentan en una población y que están relacionados con su sobrevivencia.
Ecología aplicada
Representa la tendencia moderna de protección a la naturaleza y el equilibrio de ésta en el medio humano rural y urbano.
Ecología de sistemas
Probablemente sea la más moderna rama de esta ciencia emplea las matemáticas aplicadas en modelos matemáticos y de computadoras para lograr la comprensión de la compleja problemática ecológica.
Existen otras ramas de esta ciencia, como la ecología microbiana que junto con algunas aplicaciones de la microbiología industrial, de la ingeniería sanitaria y la ingeniería ambiental han dado origen a las aplicaciones industriales de los biotratamientos y tecnologías de recuperación de los ecosistemas
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